Арени была старой и значимой деревней гавара Вайоц Дзор Сюникского ашхара. В 13-м веке князь Тарсаич Орбелян перенес княжеский престольный центр из поселка Ехегиса в Арени. Церковь Св.Богородицы находится на возвышенности у восточного края деревни. Ее построил архитектор-скульптор и художник Момик в 1321г.